種子水分是影響種子的壽命和安全貯藏的重要因素，也是種子分級的主要指標之一。
1、霉變：貯藏期間，種子水分過高，呼吸作用旺盛，產生大量呼吸熱和水分，會引起種子堆發熱而霉變（如本地夏播種子、東北種子水分高，＞14％到6月在山東就會產生霉變）。
2、藥害：高水分種子呼吸旺盛，藥劑熏倉時吸入過多藥量而產生藥害，從而降低生活力。（庫存種子越夏熏倉前必須曬種子）。
3、凍害：高水分種子易發生凍害而降低發芽率。（發生凍害胚與胚乳分離，胚部發黑：水分20％不宜在-2℃冷凍；18％不宜在-5℃冷凍；17％不宜在-8℃冷凍）。
因此，種子在加工、包裝前、熏蒸前、貯藏期間，都必須進行水分測定。絕不允許不符合安全水分標準的種子入庫。
種子水分測定的方法很多，可概括為：標準測定法和其他測定法。標推測定方法：烘干減重法、正式檢驗報告用。其他方法有：快速法、滴定法、蒸餾法。其中快速法：利用電子儀器(如電容式、電阻式
谷物水分測試儀）。
